Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Mdga2-212ENSMUST00000222987 1388 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm14609-201ENSMUST00000122176 902 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm15520-201ENSMUST00000132097 1203 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Apela-202ENSMUST00000142822 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm5473-201ENSMUST00000179326 642 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm18029-201ENSMUST00000219973 844 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 AC113031.2-201ENSMUST00000226132 579 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 AC161877.1-201ENSMUST00000227736 699 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Olfr573-ps1-201ENSMUST00000064830 888 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Olfr1280-201ENSMUST00000082167 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Immt-201ENSMUST00000064062 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms