Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms