Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
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Gm8356J3QPD3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Gm8356J3QPD3 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Gm8356J3QPD3 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Gm8356J3QPD3 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
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Gm8356J3QPD3 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Gm8356J3QPD3 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Gm8356J3QPD3 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Gm8356J3QPD3 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Gm8356J3QPD3 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Gm8356J3QPD3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Gm8356J3QPD3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Gm8356J3QPD3 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
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Gm8356J3QPD3 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Gm8356J3QPD3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm8356J3QPD3 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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Gm8356J3QPD3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
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