Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21060J3KMU4 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms