Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms