Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Zfp275-202ENSMUST00000114499 6284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Serpinc1-201ENSMUST00000064725 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb43-201ENSMUST00000028125 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms