Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.1 ms