Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms