Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Mterf1bB9EJ57 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Mterf1bB9EJ57 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Mterf1bB9EJ57 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Mterf1bB9EJ57 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Mterf1bB9EJ57 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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Mterf1bB9EJ57 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mterf1bB9EJ57 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms