Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Phf11cB4XVP9 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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