Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms