Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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PtprbB2RU80 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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