Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NhsB1AV60 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NhsB1AV60 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NhsB1AV60 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NhsB1AV60 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NhsB1AV60 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NhsB1AV60 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NhsB1AV60 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NhsB1AV60 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NhsB1AV60 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NhsB1AV60 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NhsB1AV60 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NhsB1AV60 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NhsB1AV60 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NhsB1AV60 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NhsB1AV60 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NhsB1AV60 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NhsB1AV60 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NhsB1AV60 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NhsB1AV60 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm16477-201ENSMUST00000085365 801 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms