Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms