Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms