Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms