Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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