Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ilf3Q9Z1X4 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ilf3Q9Z1X4 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ilf3Q9Z1X4 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ilf3Q9Z1X4 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ilf3Q9Z1X4 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ilf3Q9Z1X4 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ilf3Q9Z1X4 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ilf3Q9Z1X4 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ilf3Q9Z1X4 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ilf3Q9Z1X4 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ilf3Q9Z1X4 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ilf3Q9Z1X4 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ilf3Q9Z1X4 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ilf3Q9Z1X4 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ilf3Q9Z1X4 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ilf3Q9Z1X4 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ilf3Q9Z1X4 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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