Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV32

Arpc1b, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc1bQ9WV32 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Arpc1bQ9WV32 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Arpc1bQ9WV32 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Arpc1bQ9WV32 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Arpc1bQ9WV32 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Arpc1bQ9WV32 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Arpc1bQ9WV32 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms