Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PplQ9R269 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PplQ9R269 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PplQ9R269 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PplQ9R269 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms