Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma4Q9R1P0 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms