Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Cntnap2-201ENSMUST00000060839 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Gm8261-201ENSMUST00000119275 1208 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms