Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Ndrg3Q9QYF9 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Ndrg3Q9QYF9 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndrg3Q9QYF9 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms