Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms