Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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Col5a3Q9JLI2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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