Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Gde1Q9JL56 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Gde1Q9JL56 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Gde1Q9JL56 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Gde1Q9JL56 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Gde1Q9JL56 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Gde1Q9JL56 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Gde1Q9JL56 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gde1Q9JL56 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gde1Q9JL56 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gde1Q9JL56 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gde1Q9JL56 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gde1Q9JL56 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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