Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms