Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl4Q9DCU6 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms