Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syde1Q9DBZ9 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms