Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Smg9Q9DB90 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Smg9Q9DB90 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Smg9Q9DB90 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Smg9Q9DB90 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Smg9Q9DB90 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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