Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms