Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fip1l1Q9D824 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms