Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Cldn22Q9D7U6 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Cldn22Q9D7U6 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Cldn22Q9D7U6 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Cldn22Q9D7U6 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Cldn22Q9D7U6 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Cldn22Q9D7U6 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Cldn22Q9D7U6 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Cldn22Q9D7U6 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Cldn22Q9D7U6 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Cldn22Q9D7U6 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Cldn22Q9D7U6 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Cldn22Q9D7U6 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms