Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Srp19Q9D7A6 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Srp19Q9D7A6 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Srp19Q9D7A6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Srp19Q9D7A6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Srp19Q9D7A6 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Srp19Q9D7A6 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Srp19Q9D7A6 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Srp19Q9D7A6 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Srp19Q9D7A6 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Srp19Q9D7A6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Srp19Q9D7A6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Srp19Q9D7A6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Srp19Q9D7A6 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Srp19Q9D7A6 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Srp19Q9D7A6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Srp19Q9D7A6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Srp19Q9D7A6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Srp19Q9D7A6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms