Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Phf6Q9D4J7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Phf6Q9D4J7 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Phf6Q9D4J7 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Phf6Q9D4J7 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Phf6Q9D4J7 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Phf6Q9D4J7 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Phf6Q9D4J7 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Phf6Q9D4J7 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Phf6Q9D4J7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf6Q9D4J7 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms