Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syce1Q9D495 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms