Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms