Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhobtb3Q9CTN4 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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