Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Ifna13-201ENSMUST00000105149 819 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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