Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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