Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Chmp3Q9CQ10 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms