Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ssxb1Q9CPU1 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ssxb1Q9CPU1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ssxb1Q9CPU1 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ssxb1Q9CPU1 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ssxb1Q9CPU1 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ssxb1Q9CPU1 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ssxb1Q9CPU1 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb1Q9CPU1 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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