Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krt88Q9CPR6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Krt88Q9CPR6 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms