Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms