Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt23Q99PS0 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms