Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Ubqln4Q99NB8 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Ubqln4Q99NB8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Ubqln4Q99NB8 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Ubqln4Q99NB8 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Ubqln4Q99NB8 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Ubqln4Q99NB8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Ubqln4Q99NB8 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Ubqln4Q99NB8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Ubqln4Q99NB8 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Ubqln4Q99NB8 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Ubqln4Q99NB8 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Ubqln4Q99NB8 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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