Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Sh3bp5lQ99LH9 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Sh3bp5lQ99LH9 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Sh3bp5lQ99LH9 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Sh3bp5lQ99LH9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Sh3bp5lQ99LH9 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Sh3bp5lQ99LH9 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Sh3bp5lQ99LH9 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp5lQ99LH9 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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