Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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Hps4Q99KG7 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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Hps4Q99KG7 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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