Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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TrabdQ99JY4 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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TrabdQ99JY4 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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TrabdQ99JY4 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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TrabdQ99JY4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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TrabdQ99JY4 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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TrabdQ99JY4 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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TrabdQ99JY4 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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TrabdQ99JY4 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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