Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nrif1Q923B3 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms